De retour dans sa propre ligne temporelle, Kaname découvre un Tokyo complètement dévasté. Pris de panique, il part à la recherche de ses amis et, quand il les retrouve enfin, il apprend que cinq années se sont écoulées depuis son départ ! En son absence, les Sunset Ravens ont dû affronter des Greeds humanoïdes, un nouveau type d’ennemis qui sèment la destruction sur leur passage…
 
Pour faire face à une telle situation, les joueurs du Darwin’s Game ont formé une communauté soudée, d’autant que l’application a cessé de fonctionner et n’enregistre plus de nouveaux participants. Dans ces conditions, l’équipe des Ravens est plus déterminée que jamais à retrouver la trace du maître de jeu…